84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1658 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1658  phage tail protein  100 
 
 		 146 aa  300  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664664  normal  0.0320443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2822  phage tail protein  98.63 
 
 		 146 aa  298  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0976  hypothetical protein  41.67 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3817  phage tail protein  46.09 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0125737  normal  0.215522 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1873  phage tail region protein  40.31 
 
 		 146 aa  106  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0802  conserved hypothetical phage tail protein  35.71 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.286471 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2895  hypothetical protein  34.27 
 
 		 179 aa  98.2  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2820  phage tail protein  36.43 
 
 		 142 aa  96.7  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3151  phage tail protein  42.34 
 
 		 142 aa  96.7  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1039  hypothetical protein  36.81 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1900  hypothetical protein  33.57 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0408568  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3006  hypothetical protein  36.99 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5390  hypothetical protein  34.53 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1959  hypothetical protein  35.04 
 
 		 147 aa  90.5  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.663764  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2465  hypothetical protein  36.03 
 
 		 152 aa  90.5  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.325818 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4345  hypothetical protein  39.67 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0854635  normal  0.111661 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0680  hypothetical protein  38.28 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0979  hypothetical protein  37.41 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.965809  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3613  phage tail region protein  39.42 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436246 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1660  phage tail protein  36.43 
 
 		 142 aa  88.2  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.274017  normal  0.160769 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5254  hypothetical protein  38.57 
 
 		 147 aa  87.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600416 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0931  phage tail protein  34.03 
 
 		 150 aa  87  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.339945  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0673  hypothetical protein  38.46 
 
 		 143 aa  87  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4343  hypothetical protein  37.14 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0471416  normal  0.110764 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1502  hypothetical protein  35.92 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2939  hypothetical protein  34.04 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230933  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0372  phage tail protein  37.23 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1686  hypothetical protein  41.55 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2546  conserved hypothetical phage tail protein  40.56 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2190  hypothetical protein  38.73 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.376817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3661  hypothetical protein  34.75 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0365523  hitchhiker  0.000649304 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1957  hypothetical protein  37.59 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1505  hypothetical protein  34.78 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1728  conserved hypothetical phage tail protein  30.43 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000263815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1879  hypothetical protein  33.06 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0889335  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1630  conserved hypothetical phage tail protein  35.61 
 
 		 182 aa  77  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3923  hypothetical protein  34.56 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000169175  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2943  hypothetical protein  30.15 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159813  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1561  phage tail protein  33.88 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.187603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0803  conserved hypothetical phage tail protein  31.82 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4388  hypothetical protein  32.14 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5386  hypothetical protein  27.97 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1423  hypothetical protein  29.22 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1040  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.5 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3039  phage tail protein  33.6 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000483158 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0757  hypothetical protein  26.57 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3612  phage tail region protein  29.45 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000736395 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2547  conserved hypothetical phage tail protein  30.41 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0371  phage tail protein  34.4 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2464  hypothetical protein  29.84 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1055  hypothetical protein  31.25 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1904  hypothetical protein  32.86 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0753341  hitchhiker  0.00215477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3005  hypothetical protein  30.71 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1881  hypothetical protein  31.72 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0472148  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1685  hypothetical protein  29.73 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26530  conserved hypothetical phage tail region protein  30.07 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.167509  normal  0.504413 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0928  phage tail protein  30.5 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0917106  normal  0.176994 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2993  hypothetical protein  33.61 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2265  hypothetical protein  31.45 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.000466935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1504  hypothetical protein  27.52 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3037  phage tail protein  31.62 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000349431 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0862  hypothetical protein  29.33 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0831  hypothetical protein  27.52 
 
 		 174 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.339672  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1823  phage tail protein  26.85 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2261  hypothetical protein  27.83 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0999521  hitchhiker  0.00060193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1058  hypothetical protein  27.1 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3152  phage tail protein  28.33 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26560  conserved hypothetical phage tail region protein  30.53 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00415635  normal  0.705478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0656  hypothetical protein  30.15 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0846  hypothetical protein  30.15 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4384  hypothetical protein  27.42 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1420  hypothetical protein  26.92 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0679  hypothetical protein  26.9 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0761  hypothetical protein  29.53 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00269614  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0672  hypothetical protein  29.75 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3820  phage tail protein  24.46 
 
 		 178 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0449238  normal  0.0664032 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1129  hypothetical protein  27.52 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1730  hypothetical protein  38.6 
 
 		 165 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000514392 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1757  phage tail protein  25.5 
 
 		 169 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657496 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1826  phage tail protein  25.85 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1743  conserved hypothetical phage tail protein  27.07 
 
 		 194 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3924  hypothetical protein  23.2 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000187514  hitchhiker  0.00829413 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2563  hypothetical protein  26 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00285487  hitchhiker  0.0000000213199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5253  hypothetical protein  29.35 
 
 		 154 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00063173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>