13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1440 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1440  CRISPR-associated RAMP Csx10 family protein  100 
 
 		 402 aa  823    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0367  hypothetical protein  30.86 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107186 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2386  Csx10 family CRISPR-associated RAMP protein  24.65 
 
 		 426 aa  111  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0190  hypothetical protein  30.1 
 
 		 391 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1803  CRISPR-associated RAMP Csx10 family protein  25.4 
 
 		 423 aa  98.2  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0982  hypothetical protein  29.29 
 
 		 408 aa  97.1  5e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3293  hypothetical protein  25.06 
 
 		 776 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.642367  normal  0.855999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1860  hypothetical protein  25.11 
 
 		 821 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.441776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1071  protein of unknown function DUF324  25.06 
 
 		 778 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5584  protein of unknown function DUF324  25.08 
 
 		 649 aa  57  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1917  CRISPR-associated RAMP Csx10 family protein  22.19 
 
 		 526 aa  53.5  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2053  hypothetical protein  21.22 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20520  hypothetical protein  33.86 
 
 		 328 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859157  normal  0.365267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>