12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0643 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0643  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.908214  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1248  hypothetical protein  29.46 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4554  hypothetical protein  29.41 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4056  hypothetical protein  28.69 
 
 		 241 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1332  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1018  hypothetical protein  28.85 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2145  hypothetical protein  30.77 
 
 		 204 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3190  hypothetical protein  33.64 
 
 		 349 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0127935  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3627  hypothetical protein  28.57 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.805945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3073  hypothetical protein  32.33 
 
 		 312 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0298  hypothetical protein  32.91 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.532788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0280  hypothetical protein  30.43 
 
 		 131 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>