11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5030 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5030  copper/silver resistance protein CusD  100 
 
 		 133 aa  273  7e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.324306  normal  0.155769 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1806  hypothetical protein  48.53 
 
 		 136 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.355475  normal  0.637829 
 
 
-
 
NC_003296  RS05408  hypothetical protein  46.62 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6133  copper/silver resistance transmembrane protein SilD  45.19 
 
 		 131 aa  83.6  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.437215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1649  hypothetical protein  46.72 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.401452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5358  hypothetical protein  45.56 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5290  hypothetical protein  46.59 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3494  hypothetical protein  35.77 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0476  hypothetical protein  32.72 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2156  hypothetical protein  32.21 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000251475  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1624  hypothetical protein  29.41 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.126845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>