18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4571 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3986  hypothetical protein  82.11 
 
 		 434 aa  714    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4571  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  871    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105208  hitchhiker  0.00903491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0466  protein of unknown function DUF1688  54.28 
 
 		 418 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.33081  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2103  hypothetical protein  50.73 
 
 		 404 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1964  hypothetical protein  50.92 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0314  hypothetical protein  49.52 
 
 		 442 aa  354  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2717  protein of unknown function DUF1688  51.47 
 
 		 418 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.970888  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2975  hypothetical protein  48.2 
 
 		 417 aa  329  6e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0496469  normal  0.454814 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2167  hypothetical protein  43.67 
 
 		 427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3258  hypothetical protein  48.3 
 
 		 405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2195  hypothetical protein  42.68 
 
 		 427 aa  320  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5280  hypothetical protein  48.43 
 
 		 392 aa  318  9e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5572  hypothetical protein  48.43 
 
 		 392 aa  318  9e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5191  hypothetical protein  48.43 
 
 		 392 aa  318  9e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.296322  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2662  protein of unknown function DUF1688  46.82 
 
 		 471 aa  312  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0729613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4220  protein of unknown function DUF1688  44.09 
 
 		 432 aa  305  8.000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08797  conserved fungal protein (AFU_orthologue; AFUA_5G09640)  36.95 
 
 		 480 aa  226  8e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.199708 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00820  conserved hypothetical protein  34.63 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>