12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2498 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2498  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  507  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0034451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0859  Tetratricopeptide TPR_4  66.26 
 
 		 252 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.414565 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0924  Tetratricopeptide TPR_4  64.61 
 
 		 252 aa  329  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.638112  normal  0.741149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0994  hypothetical protein  65.84 
 
 		 252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.391943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1986  putative transmembrane protein  53.69 
 
 		 251 aa  266  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.878282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1540  TPR repeat-containing protein  38.11 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1662  tetratricopeptide TPR_4  36.51 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.399527  normal  0.999134 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0665  tetratricopeptide TPR_4  35.89 
 
 		 244 aa  118  7e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3734  hypothetical protein  30.99 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4769  hypothetical protein  30.58 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.365157 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0637  tetratricopeptide TPR_4  28.51 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4035  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>