13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2324 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2324  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  278  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600501  hitchhiker  0.00000222052 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0545  hypothetical protein  86.67 
 
 		 135 aa  245  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4160  hypothetical protein  87.12 
 
 		 135 aa  238  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783191 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1206  hypothetical protein  92.56 
 
 		 135 aa  235  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1425  hypothetical protein  90.91 
 
 		 135 aa  233  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  0.484235 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1291  hypothetical protein  94.02 
 
 		 135 aa  231  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.609198  normal  0.777474 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2833  hypothetical protein  67.72 
 
 		 126 aa  179  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0899389  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2364  hypothetical protein  60.83 
 
 		 121 aa  153  9e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0976  hypothetical protein  60 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2224  hypothetical protein  60.83 
 
 		 121 aa  149  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.2113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4488  hypothetical protein  45.95 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59500  hypothetical protein  44.14 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000347394  hitchhiker  4.99905e-17 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0603  hypothetical protein  33.67 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>