13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2307 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2307  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  268  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000137352  hitchhiker  0.000138306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3394  hypothetical protein  98.46 
 
 		 130 aa  266  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.557375  normal  0.0300431 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1306  hypothetical protein  93.85 
 
 		 130 aa  253  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.586324  normal  0.526594 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1441  hypothetical protein  93.85 
 
 		 130 aa  253  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1219  hypothetical protein  90.77 
 
 		 130 aa  249  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344643  normal  0.41142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4153  hypothetical protein  90 
 
 		 130 aa  248  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.11154  normal  0.0419349 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0656  hypothetical protein  78.46 
 
 		 130 aa  214  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2349  hypothetical protein  75.38 
 
 		 130 aa  206  6e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.226748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0988  hypothetical protein  75.38 
 
 		 130 aa  206  6e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2230  hypothetical protein  74.62 
 
 		 130 aa  205  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0939122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0553  hypothetical protein  70.77 
 
 		 130 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2825  hypothetical protein  53.08 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0065  hypothetical protein  30.48 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>