29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1392 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1392  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  391  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.360993  normal  0.536019 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1942  hypothetical protein  83.97 
 
 		 156 aa  271  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1364  hypothetical protein  60.9 
 
 		 156 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1303  hypothetical protein  60.26 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.112284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1237  hypothetical protein  60.26 
 
 		 156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0136  hypothetical protein  56.77 
 
 		 155 aa  174  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1951  hypothetical protein  50 
 
 		 163 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3146  hypothetical protein  50.65 
 
 		 160 aa  161  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1402  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526966  normal  0.116866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0015  hypothetical protein  49.01 
 
 		 156 aa  144  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1927  hypothetical protein  50.99 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2029  hypothetical protein  51.66 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5532  hypothetical protein  52.29 
 
 		 160 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2095  hypothetical protein  50.33 
 
 		 161 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0779  hypothetical protein  50.33 
 
 		 161 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0515  hypothetical protein  50.33 
 
 		 161 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1510  hypothetical protein  50.33 
 
 		 161 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0613  hypothetical protein  50.33 
 
 		 161 aa  141  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2121  hypothetical protein  50.98 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.77747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1073  hypothetical protein  50.98 
 
 		 160 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.380832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2242  hypothetical protein  50.65 
 
 		 161 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2228  hypothetical protein  49.67 
 
 		 160 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2203  hypothetical protein  49.67 
 
 		 160 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5874  hypothetical protein  49.67 
 
 		 160 aa  136  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0452  hypothetical protein  36.08 
 
 		 155 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48710  hypothetical protein  38.93 
 
 		 157 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000390277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4172  hypothetical protein  38.26 
 
 		 157 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4034  hypothetical protein  31.58 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.148355  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0818  hypothetical protein  27.81 
 
 		 157 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>