28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1198 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1198  20S proteasome, A and B subunits  100 
 
 		 198 aa  408  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000168081  normal  0.567308 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1305  20S proteasome, A and B subunits  85.78 
 
 		 205 aa  357  5e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762491  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1617  20S proteasome A and B subunits  76.72 
 
 		 190 aa  312  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00179483  normal  0.794727 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1945  20S proteasome A and B subunits  76.72 
 
 		 190 aa  312  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0193808  hitchhiker  0.000995927 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1602  hypothetical protein  76.19 
 
 		 191 aa  308  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00717688  normal  0.186206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2670  20S proteasome, A and B subunits  52.79 
 
 		 197 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.13982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1783  20S proteasome, A and B subunits  52.79 
 
 		 196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.188776  hitchhiker  0.00607749 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2164  20S proteasome A and B subunits  51.02 
 
 		 197 aa  206  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.40361  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1847  hypothetical protein  39.56 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.722264 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  29.52 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  26.55 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1261  ATP-dependent protease peptidase subunit  27.59 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.4 
 
 		 182 aa  48.5  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.31 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1699  ATP-dependent protease peptidase subunit  26.44 
 
 		 176 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000408331  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.07 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  25.32 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2849  ATP-dependent protease peptidase subunit  25.75 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.303381 
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.31 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1310  ATP-dependent protease peptidase subunit  25.6 
 
 		 181 aa  44.7  0.0009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4128  ATP-dependent protease peptidase subunit  25.77 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  hitchhiker  0.00000056265 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  26.51 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3082  ATP-dependent protease peptidase subunit  26.51 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2179  ATP-dependent protease peptidase subunit  27.38 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00206199  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0185  ATP-dependent protease peptidase subunit  25.15 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.99 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5054  ATP-dependent protease peptidase subunit  28.33 
 
 		 187 aa  42  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.351795 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  25.88 
 
 		 175 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>