23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1775 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1775  putative orphan protein  100 
 
 		 555 aa  1123    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03446  putative orphan protein  60.66 
 
 		 564 aa  635    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1049  hypothetical protein  56.55 
 
 		 562 aa  621  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0715894  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1178  hypothetical protein  54.92 
 
 		 576 aa  606  9.999999999999999e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4243  hypothetical protein  55.8 
 
 		 552 aa  607  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2237  MutT/NUDIX family protein  38.77 
 
 		 565 aa  361  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0855857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4226  MutT/nudix family protein  34.77 
 
 		 599 aa  337  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500357  normal  0.363608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2502  hypothetical protein  41.18 
 
 		 545 aa  334  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.233242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0516  MutT/NUDIX family protein  41.23 
 
 		 565 aa  333  4e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0511  MutT/NUDIX family protein  41.23 
 
 		 565 aa  333  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203368  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0483  MutT/nudix family protein  41.52 
 
 		 565 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0528  MutT/NUDIX family protein  41.88 
 
 		 560 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2218  hypothetical protein  36.83 
 
 		 555 aa  321  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3447  Zn-dependent hydrolase  33.27 
 
 		 574 aa  289  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07015  putative dipeptidyl-peptidase III  25.4 
 
 		 671 aa  82  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3045  dipeptidyl-peptidase III  26.67 
 
 		 706 aa  80.5  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_002950  PG0317  M49 family peptidase  24.6 
 
 		 886 aa  80.1  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.620339 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3161  hypothetical protein  29.14 
 
 		 664 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2965  hypothetical protein  27.44 
 
 		 668 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.711778  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3053  hypothetical protein  28.64 
 
 		 664 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2908  hypothetical protein  24.63 
 
 		 663 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0753895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2215  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 177 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0824414  normal  0.0195588 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10540  dipeptidyl peptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G06140)  24.03 
 
 		 707 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.375473  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>