16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1645 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1645  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  333  7e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0843989  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2406  hypothetical protein  40.4 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2831  hypothetical protein  42.42 
 
 
155 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3266  hypothetical protein  42.42 
 
 
155 aa  110  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.171623  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2318  hypothetical protein  35.9 
 
 
175 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000218333  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2249  hypothetical protein  39.81 
 
 
168 aa  98.6  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000214178  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3516  hypothetical protein  39.32 
 
 
168 aa  85.5  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.296175  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3358  hypothetical protein  30.41 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0521  hypothetical protein  38.85 
 
 
172 aa  80.5  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0318053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0503  hypothetical protein  32.03 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2275  hypothetical protein  29.73 
 
 
157 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4092  hypothetical protein  33.93 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.450733 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1038  hypothetical protein  38.67 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.516506  normal  0.596721 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0174  hypothetical protein  33.71 
 
 
122 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.197157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3172  hypothetical protein  28.1 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0318  hypothetical protein  27.27 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>