16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0938 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0938  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  384  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263374  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0327  hypothetical protein  37.11 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_269  hypothetical protein  37.11 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4289  hypothetical protein  39.09 
 
 
211 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.403504  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0307  hypothetical protein  36.6 
 
 
199 aa  124  6e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3075  hypothetical protein  36.54 
 
 
222 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.587053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1163  hypothetical protein  38.16 
 
 
221 aa  118  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000227012 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4586  hypothetical protein  35.47 
 
 
218 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3102  hypothetical protein  39.2 
 
 
204 aa  115  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2195  hypothetical protein  35.1 
 
 
222 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2257  hypothetical protein  35.1 
 
 
222 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0373802 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2625  HerA-ATP synthase, barrel domain-containing protein  35.47 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1227  hypothetical protein  35.68 
 
 
200 aa  97.1  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0591  hypothetical protein  34.34 
 
 
200 aa  94.7  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.561181  hitchhiker  0.000101908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0212  hypothetical protein  34.34 
 
 
202 aa  92.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1139  hypothetical protein  25.26 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>