42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0144 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0144  GH3 auxin-responsive promoter  100 
 
 		 522 aa  1053    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1025  GH3 auxin-responsive promoter  31.87 
 
 		 494 aa  311  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02895  putative auxin-regulated protein  31.47 
 
 		 497 aa  303  4.0000000000000003e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380392  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3685  GH3 auxin-responsive promoter  32.86 
 
 		 502 aa  301  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.46637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1338  hypothetical protein  32.99 
 
 		 508 aa  300  3e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2048  GH3 auxin-responsive promoter  33.33 
 
 		 497 aa  300  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0869  GH3 auxin-responsive promoter  32.22 
 
 		 510 aa  296  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0752  GH3 auxin-responsive promoter  34.21 
 
 		 502 aa  296  8e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0190  GH3 auxin-responsive promoter  33.07 
 
 		 495 aa  296  8e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.210438  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3178  GH3 auxin-responsive promoter  32.86 
 
 		 510 aa  290  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5651  GH3 auxin-responsive promoter  33.74 
 
 		 507 aa  290  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2997  auxin-regulated protein  32.06 
 
 		 496 aa  290  6e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3419  GH3 auxin-responsive promoter  33.47 
 
 		 504 aa  288  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00655  putative plant auxin-regulated protein  32.52 
 
 		 484 aa  288  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0468  hypothetical protein  31.59 
 
 		 502 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3833  GH3 auxin-responsive promoter  32.54 
 
 		 500 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723154  normal  0.130127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5924  GH3 auxin-responsive promoter  32.41 
 
 		 500 aa  280  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3670  auxin-regulated protein  29.67 
 
 		 504 aa  277  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1720  hypothetical protein  34.37 
 
 		 509 aa  276  5e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1713  GH3 auxin-responsive promoter  31.99 
 
 		 507 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0805  auxin-responsive GH3-related protein  34.9 
 
 		 514 aa  257  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0949  GH3 auxin-responsive promoter  34.9 
 
 		 514 aa  257  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.424251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1029  GH3 auxin-responsive promoter  30.97 
 
 		 510 aa  253  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00063016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0473  GH3 auxin-responsive promoter  31.59 
 
 		 521 aa  249  9e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0118  GH3 auxin-responsive promoter  32.1 
 
 		 508 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.086469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1664  GH3 auxin-responsive promoter  31.88 
 
 		 514 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.714218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2660  auxin-regulated like  30.18 
 
 		 512 aa  233  9e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1478  GH3 auxin-responsive promoter  31.85 
 
 		 527 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.173313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1855  GH3 auxin-responsive protein  31.46 
 
 		 530 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1092  GH3 auxin-responsive promoter family protein  32.68 
 
 		 562 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0359437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2573  GH3 auxin-responsive promoter  32 
 
 		 539 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12318  hypothetical protein  27.85 
 
 		 507 aa  211  2e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0495  GH3 auxin-responsive promoter  32.68 
 
 		 528 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal  0.527563 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0617  GH3 auxin-responsive promoter  29.16 
 
 		 528 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0953  GH3 auxin-responsive promoter  24.72 
 
 		 586 aa  97.1  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0561894  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1675  GH3 auxin-responsive promoter  22.33 
 
 		 559 aa  90.9  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4770  GH3 auxin-responsive promoter  26.35 
 
 		 581 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0973169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2981  GH3 auxin-responsive promoter  23.53 
 
 		 557 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1542  hypothetical protein  29.13 
 
 		 128 aa  45.8  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2176  hypothetical protein  24.68 
 
 		 509 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0394  GH3 auxin-responsive promoter  24.43 
 
 		 547 aa  43.9  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.20196  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2150  hypothetical protein  23.89 
 
 		 509 aa  43.9  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>