15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6376 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6376  hypothetical protein  100 
 
 		 394 aa  813    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12547  normal  0.702736 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0998  hypothetical protein  65.98 
 
 		 393 aa  548  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0476  hypothetical protein  33.57 
 
 		 412 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4246  hypothetical protein  31.97 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111779  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1555  hypothetical protein  33.82 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2098  conserved hypothetical alanine-rich protein  29.31 
 
 		 395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000748992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0478  hypothetical protein  29.25 
 
 		 408 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1489  hypothetical protein  36.95 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1082  hypothetical protein  35.59 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0109535  hitchhiker  0.00376234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5155  putative alanine-rich protein  29.1 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.215555  normal  0.0173621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1956  putative alanine-rich protein  30.77 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0753  hypothetical protein  30.41 
 
 		 379 aa  81.6  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5105  hypothetical protein  28.78 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.967556  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3556  hypothetical protein  25.77 
 
 		 444 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.394586  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4386  hypothetical protein  24.42 
 
 		 494 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>