20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5917 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5917  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.567263  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2377  hypothetical protein  66.67 
 
 
90 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0704345  hitchhiker  0.00399163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5212  hypothetical protein  63.33 
 
 
95 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1930  hypothetical protein  58.06 
 
 
93 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1286  hypothetical protein  52.81 
 
 
90 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3216500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3576  hypothetical protein  52.81 
 
 
90 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.221494  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5720  hypothetical protein  51.69 
 
 
90 aa  99.4  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.470242  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0894  hypothetical protein  50.56 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00183124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4336  hypothetical protein  50.56 
 
 
90 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.022904  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1705  hypothetical protein  49.45 
 
 
91 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2091  hypothetical protein  46.67 
 
 
90 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395312  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4610  hypothetical protein  45.56 
 
 
90 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.553384  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2131  hypothetical protein  47.25 
 
 
91 aa  90.5  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1968  hypothetical protein  46.07 
 
 
92 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2189  hypothetical protein  46.07 
 
 
90 aa  85.9  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6474  hypothetical protein  37.36 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151582  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3546  hypothetical protein  39.02 
 
 
91 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0703945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0406  hypothetical protein  28.89 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5182  hypothetical protein  35.42 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870922  normal  0.271162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3283  hypothetical protein  42 
 
 
106 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114531  normal  0.185458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>