20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3588 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3588  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0355167 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3287  hypothetical protein  80.77 
 
 
183 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1430  hypothetical protein  50.82 
 
 
189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2699  hypothetical protein  41.71 
 
 
203 aa  117  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1755  hypothetical protein  30.43 
 
 
182 aa  112  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.961284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2037  hypothetical protein  30.6 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.291889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1798  hypothetical protein  29.89 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.880699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1938  hypothetical protein  29.89 
 
 
182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2016  hypothetical protein  30.05 
 
 
179 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.664409  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1772  hypothetical protein  31.15 
 
 
182 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0436787  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1470  hypothetical protein  31.32 
 
 
191 aa  102  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1750  hypothetical protein  27.87 
 
 
182 aa  99.4  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0127441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1973  hypothetical protein  27.81 
 
 
167 aa  91.3  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22827e-16 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4194  hypothetical protein  30.81 
 
 
216 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.862183 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4172  hypothetical protein  30.81 
 
 
216 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.668567  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3323  hypothetical protein  30.81 
 
 
192 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1829  hypothetical protein  29.19 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1937  hypothetical protein  28.57 
 
 
167 aa  82  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3405  hypothetical protein  26.79 
 
 
167 aa  82  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5022  hypothetical protein  33.85 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00332946  normal  0.0559507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>