28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1862 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1862  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.588861  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1681  hypothetical protein  92.41 
 
 		 159 aa  290  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3769  hypothetical protein  67.31 
 
 		 165 aa  217  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01185  hypothetical protein  50.67 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.395716  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4237  hypothetical protein  44.23 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4129  hypothetical protein  44.23 
 
 		 165 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.402697  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3390  hypothetical protein  45.33 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898354 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0422  hypothetical protein  43.92 
 
 		 161 aa  130  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2903  hypothetical protein  45.21 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1716  hypothetical protein  46.76 
 
 		 167 aa  127  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3588  hypothetical protein  49.01 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1906  hypothetical protein  42.57 
 
 		 165 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74595  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2683  hypothetical protein  44.67 
 
 		 164 aa  120  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.570135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3348  hypothetical protein  45.21 
 
 		 163 aa  120  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3836  hypothetical protein  48.98 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.437346  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4463  hypothetical protein  43.66 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0446649  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4272  hypothetical protein  47.95 
 
 		 185 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1596  hypothetical protein  48.61 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0037  hypothetical protein  42.47 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0250  hypothetical protein  42.47 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.483559  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1856  hypothetical protein  41.78 
 
 		 173 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39497  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2696  hypothetical protein  41.78 
 
 		 173 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3271  hypothetical protein  41.78 
 
 		 173 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0037  hypothetical protein  41.78 
 
 		 173 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000247  permease  40.13 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00090  predicted membrane protein  35.62 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1783  hypothetical protein  35.81 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3786  hypothetical protein  32.65 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0426513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>