17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1167 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1167  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  169  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.718509  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1015  hypothetical protein  96.47 
 
 
85 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.737954  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0708  hypothetical protein  83.53 
 
 
89 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1464  hypothetical protein  80 
 
 
85 aa  122  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0663  hypothetical protein  52.94 
 
 
88 aa  90.9  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.358375  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0670  hypothetical protein  52.94 
 
 
88 aa  90.9  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2616  hypothetical protein  50.59 
 
 
85 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.363218  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2379  hypothetical protein  38.89 
 
 
88 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.630868 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0961  hypothetical protein  44.87 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2702  hypothetical protein  36.62 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0227124  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4017  hypothetical protein  35.21 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1259  hypothetical protein  33.82 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.220522  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4329  hypothetical protein  35.21 
 
 
88 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1241  hypothetical protein  33.33 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1478  hypothetical protein  31.58 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0756  hypothetical protein  29.11 
 
 
98 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.477341  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1126  hypothetical protein  32.31 
 
 
87 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal  0.683214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>