38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1148 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1148  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0995  hypothetical protein  92.86 
 
 
196 aa  330  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5943  hypothetical protein  53.18 
 
 
177 aa  158  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0572526  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  44.02 
 
 
191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0679  hypothetical protein  43.86 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  43.79 
 
 
190 aa  128  6e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  43.79 
 
 
190 aa  128  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  37.97 
 
 
208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  33.33 
 
 
200 aa  119  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1855  hypothetical protein  36.23 
 
 
210 aa  118  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  41.67 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  35.38 
 
 
218 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  34 
 
 
218 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  34 
 
 
218 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0515  hypothetical protein  34.67 
 
 
210 aa  95.5  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  32.54 
 
 
218 aa  94.7  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  39.67 
 
 
218 aa  88.6  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2564  hypothetical protein  44.9 
 
 
234 aa  82  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164456  hitchhiker  0.00170184 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  30.57 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  28.9 
 
 
210 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  31.03 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  28.4 
 
 
171 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  31.72 
 
 
165 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  25.95 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  26.75 
 
 
169 aa  52.4  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  29.53 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1386  hypothetical protein  28.57 
 
 
151 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  33.77 
 
 
160 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  31.58 
 
 
162 aa  46.2  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  25.36 
 
 
397 aa  45.1  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  26.62 
 
 
160 aa  44.7  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1152  Protein of unknown function DUF2062  27.52 
 
 
165 aa  43.9  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  33.33 
 
 
160 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  26.09 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  35.53 
 
 
176 aa  42  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  31.65 
 
 
165 aa  41.6  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  24.31 
 
 
151 aa  41.6  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0633  hypothetical protein  25.71 
 
 
177 aa  41.2  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>