15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0381 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0381  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  248  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256376  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0349  hypothetical protein  98.35 
 
 
121 aa  244  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.379699  normal  0.475315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0777  hypothetical protein  79.34 
 
 
121 aa  204  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0287  hypothetical protein  64.91 
 
 
122 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526656  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0268  hypothetical protein  42.59 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0668  hypothetical protein  37.38 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.307794 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0694  hypothetical protein  39.39 
 
 
114 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236825  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1696  hypothetical protein  37.62 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.730488  normal  0.0319054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0705  hypothetical protein  39.39 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0323976  normal  0.180125 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4182  hypothetical protein  37.74 
 
 
156 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1128  hypothetical protein  37.14 
 
 
158 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.881437  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1033  hypothetical protein  37.14 
 
 
175 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1122  hypothetical protein  32.99 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6519  hypothetical protein  38.61 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.012784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6733  hypothetical protein  36.89 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.670716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>