18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0216 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0216  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  270  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378879  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0187  hypothetical protein  99.27 
 
 		 137 aa  270  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0137  hypothetical protein  66.18 
 
 		 136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.171445  normal  0.390949 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0579  hypothetical protein  66.18 
 
 		 137 aa  159  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3970  hypothetical protein  55.97 
 
 		 140 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0740  hypothetical protein  53.73 
 
 		 136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0789  hypothetical protein  52.99 
 
 		 136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0429  hypothetical protein  56.15 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0510307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0016  hypothetical protein  49.59 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3038  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2205  hypothetical protein  43.94 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3618  hypothetical protein  41.04 
 
 		 138 aa  96.7  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.852641  normal  0.135457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2260  hypothetical protein  41.86 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0583  hypothetical protein  40.31 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2236  hypothetical protein  40.31 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.866818 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0486  hypothetical protein  39.53 
 
 		 151 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.609033  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1577  hypothetical protein  41.22 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401749  normal  0.0172264 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1320  hypothetical protein  41.22 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0990906  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>