19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6474 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6474  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  177  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151582  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3546  hypothetical protein  59.3 
 
 
91 aa  109  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0703945  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5182  hypothetical protein  67.06 
 
 
85 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870922  normal  0.271162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3192  hypothetical protein  39.02 
 
 
91 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0406  hypothetical protein  35.63 
 
 
88 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2377  hypothetical protein  33.71 
 
 
90 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0704345  hitchhiker  0.00399163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1930  hypothetical protein  35.96 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5917  hypothetical protein  37.36 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.567263  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5212  hypothetical protein  34.83 
 
 
95 aa  57.8  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1705  hypothetical protein  36.36 
 
 
91 aa  57  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1286  hypothetical protein  32.58 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3216500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5720  hypothetical protein  32.58 
 
 
90 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.470242  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2131  hypothetical protein  32.58 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0894  hypothetical protein  29.21 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00183124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4336  hypothetical protein  31.46 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.022904  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3576  hypothetical protein  29.21 
 
 
90 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.221494  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2091  hypothetical protein  30.34 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0395312  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1968  hypothetical protein  29.21 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3283  hypothetical protein  37.25 
 
 
106 aa  43.5  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.114531  normal  0.185458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>