18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1972 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1972  protein of unknown function DUF922  100 
 
 
208 aa  428  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.416237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2184  protein of unknown function DUF922  94.71 
 
 
208 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.426082  normal  0.0144994 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1535  hypothetical protein  53.44 
 
 
226 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2245  hypothetical protein  47.45 
 
 
224 aa  201  9e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1411  hypothetical protein  41.75 
 
 
207 aa  175  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2114  hypothetical protein  42.93 
 
 
206 aa  168  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0994  hypothetical protein  42.47 
 
 
197 aa  162  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1028  hypothetical protein  43.26 
 
 
206 aa  154  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0750897  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2492  hypothetical protein  22.08 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.122738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0920  hypothetical protein  24.26 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.901036  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4432  hypothetical protein  23.71 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266616  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0530  protein of unknown function DUF922  27.11 
 
 
209 aa  52.4  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0183293  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0542  protein of unknown function DUF922  26.32 
 
 
209 aa  48.9  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0206  secreted Zn-dependent protease-like protein  26.12 
 
 
184 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376649  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3701  hypothetical protein  22.78 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2949  secreted Zn-dependent protease-like protein  24.22 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4366  hypothetical protein  23.76 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0011  hypothetical protein  24.56 
 
 
202 aa  42  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>