29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1578 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1578  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.767865  normal  0.508227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1775  hypothetical protein  95.68 
 
 
278 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1124  hypothetical protein  63.1 
 
 
272 aa  363  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.595917  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2529  hypothetical protein  50.92 
 
 
272 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2028  hypothetical protein  47.69 
 
 
279 aa  258  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0094929  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1164  hypothetical protein  50 
 
 
280 aa  246  4e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1121  hypothetical protein  50 
 
 
280 aa  246  4e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.619187  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1791  hypothetical protein  40.51 
 
 
302 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.294448  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3545  hypothetical protein  35.74 
 
 
288 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1380  hypothetical protein  34.18 
 
 
278 aa  175  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1346  hypothetical protein  39.92 
 
 
302 aa  175  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2446  hypothetical protein  34.05 
 
 
296 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.33058  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3312  hypothetical protein  34.97 
 
 
290 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0618924  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3042  hypothetical protein  36.07 
 
 
273 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539161  normal  0.260589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2409  hypothetical protein  35.46 
 
 
286 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.186986 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0582  hypothetical protein  34.78 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104699  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5187  hypothetical protein  37.45 
 
 
288 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.62549 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4720  hypothetical protein  37.45 
 
 
288 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5259  protein of unknown function DUF1849  36 
 
 
293 aa  163  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245499  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4750  hypothetical protein  33.92 
 
 
285 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.838034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1428  hypothetical protein  33.68 
 
 
295 aa  160  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.679604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1867  hypothetical protein  35.39 
 
 
299 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.265599  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7421  hypothetical protein  35.02 
 
 
284 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6683  hypothetical protein  37.07 
 
 
285 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3794  hypothetical protein  33.7 
 
 
273 aa  122  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.437182 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2808  hypothetical protein  32.94 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70434  normal  0.727732 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2069  hypothetical protein  27.86 
 
 
283 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0449  Domain of unknown function DUF1849  26.81 
 
 
281 aa  77  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0157  hypothetical protein  26.94 
 
 
275 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.375382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>