12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0672 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0672  hypothetical protein  100 
 
 
1124 aa  2306    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0145  normal  0.532736 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5230  hypothetical protein  25.51 
 
 
1335 aa  212  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211402  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1013  hypothetical protein  21.63 
 
 
1314 aa  191  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1811  hypothetical protein  23.99 
 
 
1339 aa  164  9e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.455816  normal  0.488445 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08265  hypothetical protein  22.78 
 
 
1347 aa  106  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0556127  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2106  hypothetical protein  25.45 
 
 
1327 aa  83.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4333  hypothetical protein  22.16 
 
 
1444 aa  66.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1374  hypothetical protein  21.01 
 
 
1459 aa  57.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.153977  normal  0.0344633 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1283  hypothetical protein  21.83 
 
 
1421 aa  52.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000525148 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0637  hypothetical protein  21.45 
 
 
1448 aa  52  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1092  hypothetical protein  20.49 
 
 
1431 aa  49.7  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2395  hypothetical protein  23.88 
 
 
1432 aa  45.8  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.86656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>