64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2257 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2257  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 120 aa  243  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2517  type IV pilus assembly PilZ  86.49 
 
 		 126 aa  202  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.179103  hitchhiker  0.00950119 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3410  type IV pilus assembly PilZ  77.97 
 
 		 119 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.595597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1985  type IV pilus assembly PilZ  80.51 
 
 		 119 aa  195  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1719  type IV pilus assembly PilZ  80.51 
 
 		 119 aa  195  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.137522 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1007  type IV pilus assembly PilZ  76.23 
 
 		 122 aa  192  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3390  type IV pilus assembly PilZ  72.88 
 
 		 119 aa  189  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2856  type IV pilus assembly PilZ  81.98 
 
 		 126 aa  188  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1858  type IV pilus assembly protein  69.91 
 
 		 129 aa  175  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.595679 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1880  type IV pilus assembly PilZ  66.67 
 
 		 126 aa  171  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0639562 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1950  type IV pilus assembly PilZ  70.27 
 
 		 126 aa  169  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.700098 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2501  type IV pilus assembly PilZ  53.04 
 
 		 121 aa  139  9e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.313407  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2195  Type IV pilus assembly PilZ  52.5 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.609234 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1541  type IV pilus assembly protein PilZ  51.35 
 
 		 123 aa  130  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0811165  normal  0.123076 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1436  Type IV pilus assembly PilZ  50 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1414  type IV pilus assembly PilZ  49.15 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.152869  normal  0.660499 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1994  type 4 fimbrial biogenesis protein PilZ  50.45 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1827  type IV pilus assembly PilZ  51.82 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2201  type 4 fimbrial biogenesis protein PilZ  49.11 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1573  type IV pilus assembly PilZ  47.75 
 
 		 116 aa  120  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25770  type 4 fimbrial biogenesis protein PilZ  49.11 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.961132  normal  0.553234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1635  type IV pilus assembly PilZ  49.11 
 
 		 118 aa  120  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1654  Type IV pilus assembly PilZ  51.33 
 
 		 118 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0394922  normal  0.307598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1423  type IV pilus assembly PilZ  47.75 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0879  type IV pilus assembly PilZ  46.85 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.766013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1464  type IV pilus assembly PilZ  47.75 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0634618  normal  0.0114903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1786  putative type 4 fimbrial biogenesis protein  47.79 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0774026  normal  0.113647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4150  Type IV pilus assembly PilZ  48.21 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440208  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3825  type IV pilus biogenesis protein PilZ  50.44 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0373515  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02715  type IV fimbriae assembly protein  47.75 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450475  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14990  type IV pilus assembly protein  47.71 
 
 		 118 aa  116  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1826  type IV pilus assembly PilZ  47.79 
 
 		 136 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0973096  normal  0.0117521 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1498  type IV pilus assembly PilZ  45.95 
 
 		 123 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.133421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1653  type 4 fimbrial biogenesis protein PilZ  45.95 
 
 		 117 aa  113  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1658  Type IV pilus assembly PilZ  45.3 
 
 		 123 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0211682  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1582  type IV fimbriae assembly protein  40.54 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0574097  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1639  type IV fimbriae assembly protein  40.54 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1251  type IV pilus assembly PilZ  54.13 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1608  type IV pilus assembly PilZ  40.19 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0391991  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1144  type IV pilus assembly PilZ  37.61 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.136177  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1352  hypothetical protein  38.14 
 
 		 118 aa  82.8  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1356  hypothetical protein  38.6 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2304  putative type IV pilus biogenesis protein pilZ  41.24 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1066  type IV pilus assembly PilZ  30.63 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0651699  normal  0.921742 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1312  type IV fimbriae assembly protein  30.63 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1915  type IV pilus assembly protein PilZ, putative  29.21 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1590  type IV pilus assembly PilZ  29.21 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0382259 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2049  type IV pilus assembly PilZ  34.02 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2238  type IV pilus biogenesis protein pilZ  32.99 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1581  type IV pilus assembly PilZ  31.96 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.875524  normal  0.520302 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1925  type IV pilus biogenesis protein PilZ  30.93 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2646  type IV pilus assembly PilZ  30.93 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.109453 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2041  type IV pilus biogenesis protein pilZ  32.99 
 
 		 108 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.307465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1984  type IV pilus assembly PilZ  29.9 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.748677  normal  0.0111146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1663  type IV pilus biogenesis protein pilZ  32.99 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1768  type IV pilus biogenesis protein pilZ  32.99 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.598238  normal  0.61176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1738  type IV pilus biogenesis protein pilZ  31.96 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2212  type IV pilus biogenesis protein PilZ  31.96 
 
 		 108 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2611  type IV pilus biogenesis protein pilZ  30.93 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1894  type IV pilus biogenesis protein PilZ  32.99 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0727827 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2570  type IV pilus biogenesis protein PilZ  32.99 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.207839  normal  0.0806474 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2450  type IV pilus biogenesis protein PilZ  32.99 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0971788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2457  type IV pilus biogenesis protein PilZ  32.99 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0645818  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6446  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  27.27 
 
 		 265 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>