46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1608 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1608  integral membrane protein-like  100 
 
 		 129 aa  261  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1243  hypothetical protein  68.04 
 
 		 101 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3131  hypothetical protein  52.81 
 
 		 98 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3391  hypothetical protein  66.18 
 
 		 98 aa  94  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6304  hypothetical protein  59.72 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618316  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1558  hypothetical protein  70.69 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0381215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4646  integral membrane protein-like  71.19 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0774  hypothetical protein  70 
 
 		 95 aa  82  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.754477  normal  0.205049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1429  hypothetical protein  59.7 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.411241  normal  0.655732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0588  hypothetical protein  61.9 
 
 		 110 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.147251  normal  0.641101 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0758  hypothetical protein  61.67 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.306085  normal  0.363458 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2033  hypothetical protein  60.34 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.230623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2191  hypothetical protein  55.26 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.969012  normal  0.810634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0304  hypothetical protein  52 
 
 		 98 aa  76.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237278 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5129  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1722  hypothetical protein  67.35 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.685505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1030  hypothetical protein  49.37 
 
 		 95 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.89878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3065  hypothetical protein  57.14 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.516609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0993  hypothetical protein  52.05 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2029  hypothetical protein  57.14 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5939  hypothetical protein  65.96 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.822986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5147  hypothetical protein  53.97 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4685  hypothetical protein  54.1 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.238421  normal  0.819427 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3132  hypothetical protein  48 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0812  hypothetical protein  49.33 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.114629  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0725  hypothetical protein  48.65 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002085  putative signal peptide protein  48.48 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0705  hypothetical protein  47.3 
 
 		 84 aa  57  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0945  putative signal peptide protein  44.74 
 
 		 87 aa  57  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.461777 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00352  hypothetical protein  46.97 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1619  hypothetical protein  42.67 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2358  putative signal peptide protein  38.55 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1614  hypothetical protein  41.89 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4402  signal peptide protein  50.91 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4292  putative signal peptide protein  50.91 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1005  putative signal peptide protein  41.18 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2687  signal peptide protein  50 
 
 		 87 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.13267  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0119  hypothetical protein  39.74 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4385  hypothetical protein  37.97 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0150663 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4776  hypothetical protein  33.33 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000854569 
 
 
-
 
NC_003296  RS02371  signal peptide protein  50 
 
 		 89 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.352612  normal  0.0437387 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0845  hypothetical protein  38.96 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0709  hypothetical protein  43.14 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0729  hypothetical protein  44.68 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2960  putative signal peptide protein  44.44 
 
 		 92 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0123103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2534  putative signal peptide protein  34.57 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000352088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>