14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1186 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1186  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  915    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2360  hypothetical protein  30.15 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0235  hypothetical protein  28.64 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1057  hypothetical protein  24.47 
 
 		 382 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6294  hypothetical protein  54.1 
 
 		 455 aa  73.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1418  hypothetical protein  41.18 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3160  hypothetical protein  46.88 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.44575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5348  hypothetical protein  40.98 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1789  hypothetical protein  23.4 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3242  hypothetical protein  37.5 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5084  hypothetical protein  42.62 
 
 		 229 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000765562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5049  hypothetical protein  39.58 
 
 		 216 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3225  hypothetical protein  38.78 
 
 		 268 aa  47  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6291  hypothetical protein  34.43 
 
 		 425 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>