142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0505 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0505  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  971    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.896176  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01159  hypothetical protein  36.56 
 
 
479 aa  286  4e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.490097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3067  hypothetical protein  31.2 
 
 
473 aa  224  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.385569  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0168  hypothetical protein  32.12 
 
 
455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1058  hypothetical protein  31.11 
 
 
475 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1931  acyltransferase, WS/DGAT/MGAT  29.15 
 
 
464 aa  201  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5773  hypothetical protein  31.77 
 
 
461 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.985599  normal  0.0133509 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4504  diacylglycerol O-acyltransferase  29.85 
 
 
454 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4591  diacylglycerol O-acyltransferase  29.85 
 
 
454 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177486  normal  0.413337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4887  diacylglycerol O-acyltransferase  29.64 
 
 
454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.78929  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13766  hypothetical protein  29.41 
 
 
454 aa  189  7e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.909108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13772  hypothetical protein  30.09 
 
 
448 aa  189  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0223  diacylglycerol O-acyltransferase  28.98 
 
 
475 aa  181  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.377987 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3928  acyltransferase  29.92 
 
 
478 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32874  hitchhiker  0.00623555 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1840  acyltransferase ws/dgat/mgat family protein  28.51 
 
 
461 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000718303 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0247  hypothetical protein  27.95 
 
 
479 aa  179  5.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4336  acyltransferase, WS/DGAT/MGAT  30.41 
 
 
463 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13515  hypothetical protein  30.91 
 
 
497 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.255402 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13105  hypothetical protein  26.87 
 
 
474 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.876265  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3706  diacylglycerol O-acyltransferase  28.81 
 
 
472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00641737  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1841  acyltransferase ws/dgat/mgat family protein  27.77 
 
 
486 aa  173  6.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.656327  unclonable  0.000000000740482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0533  hypothetical protein  25.62 
 
 
473 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.741698 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2903  hypothetical protein  27.16 
 
 
458 aa  169  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4801  acyltransferase, WS/DGAT/MGAT  28.57 
 
 
560 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0349  hypothetical protein  30.02 
 
 
474 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.945502  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6308  hypothetical protein  28.92 
 
 
490 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.10489 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12307  hypothetical protein  28.29 
 
 
445 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2792  diacylglycerol O-acyltransferase  29 
 
 
488 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0444  hypothetical protein  27.52 
 
 
469 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1475  hypothetical protein  29.08 
 
 
498 aa  150  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3818  acyltransferase, WS/DGAT/MGAT  28.43 
 
 
482 aa  150  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10914  hypothetical protein  28.01 
 
 
505 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11454  hypothetical protein  28.78 
 
 
459 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.098369 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4258  diacylglycerol O-acyltransferase  26.26 
 
 
473 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482141  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4344  diacylglycerol O-acyltransferase  26.26 
 
 
473 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.101615 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4637  diacylglycerol O-acyltransferase  26.26 
 
 
473 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.264973  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2303  diacylglycerol O-acyltransferase  26.21 
 
 
573 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000798294  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4270  acyltransferase, WS/DGAT/MGAT  27.56 
 
 
459 aa  139  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2127  acyltransferase  27.35 
 
 
495 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.739394  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11786  hypothetical protein  26.58 
 
 
502 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.8819799999999994e-43  hitchhiker  0.0000000721067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3331  diacylglycerol O-acyltransferase  25.83 
 
 
480 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3393  diacylglycerol O-acyltransferase  25.83 
 
 
463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3342  diacylglycerol O-acyltransferase  25.83 
 
 
463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.951275  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0685  acyltransferase, WS/DGAT/MGAT  28.6 
 
 
488 aa  134  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0191116  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0864  diacylglycerol O-acyltransferase  27.2 
 
 
461 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3910  acyltransferase, WS/DGAT/MGAT  28.36 
 
 
466 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0858  diacylglycerol O-acyltransferase  26.99 
 
 
461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.376573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0875  diacylglycerol O-acyltransferase  26.99 
 
 
461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0851  hypothetical protein  24.43 
 
 
504 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0903745  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5212  hypothetical protein  27.16 
 
 
461 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.89492  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6300  acyltransferase, WS/DGAT/MGAT  27.27 
 
 
462 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689046  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1764  hypothetical protein  27.15 
 
 
469 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.4393  normal  0.265737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1834  acyltransferase, WS/DGAT/MGAT  24.49 
 
 
571 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.104918  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30820  acyltransferase, WS/DGAT/MGAT  26.56 
 
 
480 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1389  diacylglycerol O-acyltransferase  25.97 
 
 
468 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1355  diacylglycerol O-acyltransferase  25.97 
 
 
468 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0631795  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1373  diacylglycerol O-acyltransferase  25.97 
 
 
468 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.661373  normal  0.360345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1377  acyltransferase, WS/DGAT/MGAT  25.93 
 
 
481 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891507  normal  0.419962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4703  hypothetical protein  26.63 
 
 
469 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3601  hypothetical protein  25.26 
 
 
478 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.712109  normal  0.563236 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0504  acyltransferase, WS/DGAT/MGAT  25.25 
 
 
464 aa  123  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4224  hypothetical protein  27.27 
 
 
485 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1084  putative diguanylate cyclase  25.68 
 
 
468 aa  119  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2034  hypothetical protein  25.67 
 
 
468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.641299  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1218  diacylglycerol O-acyltransferase  27.76 
 
 
483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2080  hypothetical protein  25.67 
 
 
468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.828285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2017  hypothetical protein  25.67 
 
 
468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.29751 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13151  hypothetical protein  26.6 
 
 
463 aa  117  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0192  diacylglycerol O-acyltransferase  25.21 
 
 
472 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.31439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3478  acyltransferase, WS/DGAT/MGAT  25.65 
 
 
497 aa  116  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14164  normal  0.0223274 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0195  hypothetical protein  24.22 
 
 
518 aa  116  8.999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1396  diacylglycerol O-acyltransferase  27.75 
 
 
458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0203  diacylglycerol O-acyltransferase  25 
 
 
472 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0212  diacylglycerol O-acyltransferase  25 
 
 
472 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0228  hypothetical protein  27.25 
 
 
476 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393674  normal  0.149834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1065  hypothetical protein  25.88 
 
 
456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2386  acyltransferase ws/dgat/mgat family protein  27.23 
 
 
479 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4125  diacylglycerol O-acyltransferase  27.01 
 
 
466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0439  hypothetical protein  25.87 
 
 
472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.466223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3757  diacylglycerol O-acyltransferase  25.74 
 
 
483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523667  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3830  diacylglycerol O-acyltransferase  25.74 
 
 
483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.538037  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3769  diacylglycerol O-acyltransferase  25.74 
 
 
483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3467  acyltransferase, WS/DGAT/MGAT  24.64 
 
 
466 aa  111  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00478888  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2428  hypothetical protein  26.67 
 
 
485 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146947  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4977  hypothetical protein  25.16 
 
 
454 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2545  diacylglycerol O-acyltransferase  24.27 
 
 
458 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2590  diacylglycerol O-acyltransferase  24.27 
 
 
458 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.446045  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2583  diacylglycerol O-acyltransferase  24.48 
 
 
458 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.628836  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5082  diacylglycerol O-acyltransferase  24.06 
 
 
464 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5170  diacylglycerol O-acyltransferase  24.06 
 
 
464 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2456  hypothetical protein  26.37 
 
 
471 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201972  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4042  diacylglycerol O-acyltransferase  27.59 
 
 
483 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3371  hypothetical protein  25.52 
 
 
472 aa  103  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.967999  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28000  acyltransferase, WS/DGAT/MGAT  24.35 
 
 
440 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.894837  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4091  hypothetical protein  24.44 
 
 
476 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0314886  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5461  diacylglycerol O-acyltransferase  24.6 
 
 
753 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10223  hypothetical protein  27.59 
 
 
469 aa  100  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.496676  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2761  hypothetical protein  25.85 
 
 
479 aa  100  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3546  diacylglycerol O-acyltransferase  26.87 
 
 
462 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13104  hypothetical protein  26.32 
 
 
473 aa  97.1  7e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.111009  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>