15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0218 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0218  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106209  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2946  hypothetical protein  81.17 
 
 		 155 aa  266  8e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.896453 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1626  hypothetical protein  77.92 
 
 		 154 aa  255  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0672235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3657  hypothetical protein  74.03 
 
 		 154 aa  251  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0091  hypothetical protein  71.33 
 
 		 157 aa  221  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4554  hypothetical protein  66.01 
 
 		 155 aa  211  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0706007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2698  hypothetical protein  64.05 
 
 		 155 aa  206  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1542  hypothetical protein  64.29 
 
 		 159 aa  206  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0894  hypothetical protein  63.4 
 
 		 155 aa  199  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.263402 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5125  hypothetical protein  42 
 
 		 184 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.282288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1698  hypothetical protein  33.52 
 
 		 183 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6975  hypothetical protein  34.03 
 
 		 183 aa  85.5  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8468  hypothetical protein  30.68 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09009  conserved hypothetical protein  30.26 
 
 		 180 aa  70.5  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00891  hypothetical protein  46.43 
 
 		 226 aa  40.8  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>