12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6397 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6397  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.933792  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4365  hypothetical protein  50 
 
 
224 aa  215  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5046  hypothetical protein  50.46 
 
 
224 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.776863  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5814  hypothetical protein  50.46 
 
 
224 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6835  hypothetical protein  47.69 
 
 
229 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446166  normal  0.124135 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2740  hypothetical protein  48.7 
 
 
220 aa  202  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.286647  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6827  hypothetical protein  46.73 
 
 
232 aa  197  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0370617  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6792  hypothetical protein  45.21 
 
 
229 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4454  hypothetical protein  44.04 
 
 
229 aa  180  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327935  normal  0.0437667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2809  hypothetical protein  40.8 
 
 
241 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2896  hypothetical protein  32.32 
 
 
229 aa  88.6  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6574  hypothetical protein  43.33 
 
 
82 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>