12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4988 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4988  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.348405  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4803  hypothetical protein  66.99 
 
 
207 aa  282  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100222  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0053  hypothetical protein  60 
 
 
238 aa  229  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.498454  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3581  hypothetical protein  57.3 
 
 
270 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23858  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5404  hypothetical protein  54.55 
 
 
237 aa  201  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4705  hypothetical protein  54.5 
 
 
243 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3658  hypothetical protein  54.5 
 
 
243 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0370725  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3863  hypothetical protein  55.08 
 
 
234 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3563  hypothetical protein  54.01 
 
 
231 aa  197  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.134432  normal  0.137887 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2450  hypothetical protein  52.41 
 
 
193 aa  194  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5049  hypothetical protein  53.48 
 
 
209 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.256189 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0855  hypothetical protein  53.44 
 
 
237 aa  183  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>