18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3986 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3986  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  864    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0696411  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4571  hypothetical protein  81.88 
 
 
435 aa  693    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105208  hitchhiker  0.00903491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0466  protein of unknown function DUF1688  55.29 
 
 
418 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.33081  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1964  hypothetical protein  50.58 
 
 
438 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0314  hypothetical protein  52.39 
 
 
442 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2103  hypothetical protein  50.98 
 
 
404 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2717  protein of unknown function DUF1688  51.48 
 
 
418 aa  355  6.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.970888  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2167  hypothetical protein  44.39 
 
 
427 aa  338  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2195  hypothetical protein  43.64 
 
 
427 aa  334  2e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2975  hypothetical protein  47.52 
 
 
417 aa  333  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0496469  normal  0.454814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5572  hypothetical protein  48.68 
 
 
392 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537709  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5280  hypothetical protein  48.68 
 
 
392 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0994569  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5191  hypothetical protein  48.68 
 
 
392 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.296322  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3258  hypothetical protein  47.72 
 
 
405 aa  318  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2662  protein of unknown function DUF1688  47.95 
 
 
471 aa  315  9e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0729613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4220  protein of unknown function DUF1688  45.45 
 
 
432 aa  309  5.9999999999999995e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08797  conserved fungal protein (AFU_orthologue; AFUA_5G09640)  38.36 
 
 
480 aa  230  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.199708 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00820  conserved hypothetical protein  35.35 
 
 
436 aa  218  2e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>