13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2419 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2419  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  328  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3887  hypothetical protein  55.45 
 
 		 162 aa  87.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1795  hypothetical protein  47.27 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0551004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3387  hypothetical protein  31.68 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826863  hitchhiker  0.000958811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2094  hypothetical protein  42.24 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217018  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2495  hypothetical protein  37.82 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1067  gp23  33.92 
 
 		 193 aa  52  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3932  hypothetical protein  38.26 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.751475  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1357  hypothetical protein  39.64 
 
 		 168 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.364568  normal  0.260682 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2091  protein GP55  32.5 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0071372  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2084  phage-tail assembly-like protein  32.5 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.389234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2766  hypothetical protein  39.29 
 
 		 175 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15269  normal  0.0232979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1584  hypothetical protein  38.74 
 
 		 166 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.350086  normal  0.323066 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>