28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1942 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1942  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  315  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1392  hypothetical protein  83.97 
 
 
192 aa  271  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.360993  normal  0.536019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1364  hypothetical protein  66.03 
 
 
156 aa  215  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1303  hypothetical protein  63.46 
 
 
156 aa  208  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.112284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1237  hypothetical protein  63.46 
 
 
156 aa  208  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1951  hypothetical protein  51.95 
 
 
163 aa  168  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308356  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0136  hypothetical protein  54.19 
 
 
155 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3146  hypothetical protein  51.35 
 
 
160 aa  155  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1402  hypothetical protein  50 
 
 
160 aa  154  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526966  normal  0.116866 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2095  hypothetical protein  52.98 
 
 
161 aa  146  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0779  hypothetical protein  52.98 
 
 
161 aa  146  9e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0515  hypothetical protein  52.98 
 
 
161 aa  146  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1510  hypothetical protein  52.98 
 
 
161 aa  146  9e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0613  hypothetical protein  52.98 
 
 
161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2029  hypothetical protein  52.98 
 
 
181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1927  hypothetical protein  52.32 
 
 
181 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5532  hypothetical protein  51.66 
 
 
160 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2121  hypothetical protein  50.99 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.77747  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0015  hypothetical protein  46.36 
 
 
156 aa  138  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2242  hypothetical protein  50.66 
 
 
161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1073  hypothetical protein  50.99 
 
 
160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.380832  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2203  hypothetical protein  50.33 
 
 
160 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5874  hypothetical protein  50.33 
 
 
160 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2228  hypothetical protein  50.33 
 
 
160 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527999  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0452  hypothetical protein  38.36 
 
 
155 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48710  hypothetical protein  38.26 
 
 
157 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000390277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4172  hypothetical protein  37.58 
 
 
157 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4034  hypothetical protein  29.61 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.148355  normal  0.609138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>