14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3008 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3008  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  732    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2034  hypothetical protein  82.21 
 
 		 368 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294544 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3792  hypothetical protein  56.23 
 
 		 391 aa  315  6e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.828057  hitchhiker  0.00751984 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0595  hypothetical protein  47.22 
 
 		 391 aa  313  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00974  hypothetical protein  25.56 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0574  sodium-dependent phosphate pump  25.88 
 
 		 381 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000662533  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0208  nptA protein  24.92 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00499958  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004425  sodium-dependent phosphate transporter  25.07 
 
 		 382 aa  50.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548264  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1607  Na+/Picotransporter  27.49 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33266  predicted protein  32.14 
 
 		 586 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49842  predicted protein  31.43 
 
 		 571 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1536  Na+/Picotransporter  30.07 
 
 		 388 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0578024 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00709  nptA protein  25.15 
 
 		 384 aa  43.1  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.450079  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1509  Na+/Picotransporter  30.07 
 
 		 388 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>