16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0476 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4246  hypothetical protein  82.6 
 
 		 411 aa  702    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111779  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0476  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  842    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.296248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1555  hypothetical protein  39.31 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6376  hypothetical protein  33.57 
 
 		 394 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12547  normal  0.702736 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0998  hypothetical protein  29.95 
 
 		 393 aa  192  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1082  hypothetical protein  29.79 
 
 		 384 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0109535  hitchhiker  0.00376234 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2098  conserved hypothetical alanine-rich protein  27.34 
 
 		 395 aa  124  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000748992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1489  hypothetical protein  29.17 
 
 		 377 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5155  putative alanine-rich protein  27.01 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.215555  normal  0.0173621 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0478  hypothetical protein  26.45 
 
 		 408 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5105  hypothetical protein  30.94 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.967556  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0753  hypothetical protein  25 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1956  putative alanine-rich protein  26.52 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3556  hypothetical protein  23.46 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.394586  normal  0.813753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4386  hypothetical protein  25.21 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4127  hypothetical protein  28.57 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>