16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0857 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0857  HRPW transmembrane protein  100 
 
 		 323 aa  643    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0240135 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5864  sctD; secretion-associated protein  32.37 
 
 		 346 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5647  SctD; secretion-associated protein  29.74 
 
 		 361 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0177431 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0672  secretion-associated protein  33.53 
 
 		 327 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352006  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2274  putative type III secretion apparatus protein  33.53 
 
 		 327 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2192  putative type III secretion apparatus protein  33.53 
 
 		 327 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237155  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0758  serine protease  33.53 
 
 		 335 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0473  secretion-associated protein  27.55 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1912  putative secretion-associated protein  28.95 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2004  secretion-associated protein  28.65 
 
 		 349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0432  secretion-associated protein  28.65 
 
 		 414 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.390924  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03409  HrpD5  32.06 
 
 		 252 aa  90.5  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5925  putative type III secretion apparatus protein  26.52 
 
 		 338 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1961  transmembrane protein  30.99 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1960  type III secretion inner membrane protein  39.32 
 
 		 125 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2207  type III secretion apparatus protein, YscD/HrpQ family  30.22 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>