13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3249 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3249  putative signal peptide protein  100 
 
 		 122 aa  239  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3438  putative signal peptide protein  77.59 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4070  putative signal peptide protein  47.79 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0450708  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5527  hypothetical protein  39.08 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5411  hypothetical protein  29.51 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.067432 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5076  hypothetical protein  39.74 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5270  hypothetical protein  29.66 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.8199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5656  hypothetical protein  34.15 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18701 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29230  hypothetical protein  30.34 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5362  hypothetical protein  27.12 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.303091  normal  0.949027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6340  hypothetical protein  35.62 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5140  hypothetical protein  29.9 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73030  hypothetical protein  32.5 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.458142  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>