15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3226 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3226  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  258  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000034976 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2651  hypothetical protein  86.29 
 
 		 138 aa  226  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3218  hypothetical protein  79.37 
 
 		 131 aa  207  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.648594  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0841  hypothetical protein  62.5 
 
 		 135 aa  153  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03910  hypothetical protein  62.5 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0817  hypothetical protein  44.54 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.595251  hitchhiker  0.0010958 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2070  hypothetical protein  44.17 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2838  hypothetical protein  39.02 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1307  hypothetical protein  38.21 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.478307  normal  0.112678 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2067  hypothetical protein  38.21 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0169668  normal  0.0314213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2763  hypothetical protein  36.59 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729346 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1242  hypothetical protein  36.59 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.451086  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2598  hypothetical protein  36.59 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0236117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2912  hypothetical protein  36.59 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.887727  normal  0.370558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3625  hypothetical protein  29.09 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>