15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2179 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2179  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  333  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0466  hypothetical protein  31.62 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0083717  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0381  hypothetical protein  35.83 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000537441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0392  hypothetical protein  32.48 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144961  hitchhiker  0.000428302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0406  hypothetical protein  32.48 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00038042  hitchhiker  0.0000000000953949 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0380  hypothetical protein  32.48 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0074269  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1949  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1976  hypothetical protein  28.57 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0243913 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1103  hypothetical protein  35.11 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4244  hypothetical protein  33.66 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0363  hypothetical protein  27.87 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3593  hypothetical protein  27.05 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.272187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3766  hypothetical protein  27.64 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.474482  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3833  hypothetical protein  23.77 
 
 		 170 aa  50.8  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3477  hypothetical protein  29.21 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.310415  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>