28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1364 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1364  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  316  7e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1303  hypothetical protein  89.74 
 
 		 156 aa  285  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.112284 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1237  hypothetical protein  89.74 
 
 		 156 aa  285  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1942  hypothetical protein  66.03 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1392  hypothetical protein  60.9 
 
 		 192 aa  200  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.360993  normal  0.536019 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1951  hypothetical protein  52.6 
 
 		 163 aa  166  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3146  hypothetical protein  51.33 
 
 		 160 aa  157  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183641 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1402  hypothetical protein  51.33 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0526966  normal  0.116866 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2029  hypothetical protein  49.67 
 
 		 181 aa  144  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2095  hypothetical protein  49.67 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0136  hypothetical protein  48.39 
 
 		 155 aa  142  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0779  hypothetical protein  49.67 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0515  hypothetical protein  49.67 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0613  hypothetical protein  49.67 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1510  hypothetical protein  49.67 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1927  hypothetical protein  49.01 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0015  hypothetical protein  46.36 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2121  hypothetical protein  48.34 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.77747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5532  hypothetical protein  48.34 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2242  hypothetical protein  47.37 
 
 		 161 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1073  hypothetical protein  47.68 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.380832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2203  hypothetical protein  47.68 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.868335  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2228  hypothetical protein  47.68 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.527999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5874  hypothetical protein  47.68 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0452  hypothetical protein  36.71 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.756521 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48710  hypothetical protein  38.82 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000390277 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4172  hypothetical protein  38.82 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4034  hypothetical protein  30.32 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.148355  normal  0.609138 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>