19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0544 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0544  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0426  hypothetical protein  69.95 
 
 		 191 aa  240  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.125949  hitchhiker  0.0000334915 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1709  hypothetical protein  44.32 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2964  hypothetical protein  40.11 
 
 		 190 aa  128  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2486  hypothetical protein  39.68 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0273408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2655  hypothetical protein  38.64 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00248341  unclonable  0.0000000268429 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1063  hypothetical protein  37.97 
 
 		 188 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0325013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0233  hypothetical protein  41.48 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5443  hypothetical protein  41.38 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594952  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5419  hypothetical protein  41.38 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.257905  normal  0.0113948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4850  hypothetical protein  41.38 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.436483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5306  hypothetical protein  40.8 
 
 		 197 aa  94.7  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4760  hypothetical protein  40.35 
 
 		 219 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.785775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3494  hypothetical protein  30.86 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79512  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0328  hypothetical protein  31.38 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.227086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4265  hypothetical protein  29.47 
 
 		 455 aa  69.7  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.045316  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1465  hypothetical protein  33.89 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0165  hypothetical protein  37.96 
 
 		 185 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70220  hypothetical protein  58.7 
 
 		 63 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>