17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_6025 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_6025  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  210  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0542451  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0560  hypothetical protein  93.15 
 
 		 110 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0307  hypothetical protein  79.37 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.382865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1132  hypothetical protein  76.09 
 
 		 70 aa  72.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1131  hypothetical protein  76.09 
 
 		 70 aa  72.8  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0999  hypothetical protein  55.56 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0960019  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1000  hypothetical protein  48.65 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204036  normal  0.73621 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1001  hypothetical protein  48.65 
 
 		 76 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.473211  normal  0.738354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2783  hypothetical protein  46.67 
 
 		 235 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00277795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2343  hypothetical protein  55.56 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.534452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2344  hypothetical protein  49.15 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0559  hypothetical protein  48.39 
 
 		 73 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6219  hypothetical protein  63.64 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.530764  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2638  hypothetical protein  48 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.730347  normal  0.81918 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1623  hypothetical protein  36.84 
 
 		 292 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3609  hypothetical protein  43.4 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0308  hypothetical protein  61.29 
 
 		 67 aa  40  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.588295  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>