12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2438 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2438  putative CheX protein  100 
 
 		 94 aa  193  6e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.82546  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1102  putative CheX protein  100 
 
 		 94 aa  193  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1792  hypothetical protein  70.45 
 
 		 99 aa  134  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2706  hypothetical protein  43.21 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.851372  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2843  CheX protein  35.63 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.908112  normal  0.278338 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3621  hypothetical protein  35.23 
 
 		 116 aa  50.8  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0123877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0277  CheX protein  33.71 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255242  normal  0.954082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4080  hypothetical protein  32.53 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1448  hypothetical protein  35.06 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0296  chemotaxis protein CheX  33.33 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.18336  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0328  chemotaxis protein CheX  33.33 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.822506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0233  putative chemotaxis protein CheX  33.33 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.262963  normal  0.176079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>