12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03172 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03172  putative signal peptide protein  100 
 
 		 346 aa  714    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.203589 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4360  hypothetical protein  32.45 
 
 		 352 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5111  lipoprotein  33.04 
 
 		 350 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.472196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2391  lipoprotein  29.73 
 
 		 343 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  normal  0.755106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5318  hypothetical protein  31.6 
 
 		 329 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2685  hypothetical protein  26.14 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.282963  normal  0.122648 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1343  putative secreted protein  25 
 
 		 361 aa  56.2  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00928694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6719  hypothetical protein  24.32 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.759063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2996  acid phosphatase  25.26 
 
 		 582 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02335  hypothetical protein  24.5 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15036  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4172  hypothetical protein  27.03 
 
 		 349 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.204573  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1858  hypothetical protein  24.6 
 
 		 342 aa  43.5  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>