15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02976 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02976  prolin-rich transmembrane protein  100 
 
 		 170 aa  333  7e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2292  hypothetical protein  36.72 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327454  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1986  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0936785  normal  0.343947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2458  hypothetical protein  36.36 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1337  hypothetical protein  29.82 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2584  putative prolin-rich transmembrane protein  34.09 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2467  hypothetical protein  32.14 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.564543  normal  0.906023 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4707  hypothetical protein  45.65 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.813409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3227  proline-rich transmembrane protein  32.74 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1299  prolin-rich transmembrane protein  37.22 
 
 		 176 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.033846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2415  putative prolin-rich transmembrane protein  30.99 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2304  hypothetical protein  37.5 
 
 		 205 aa  45.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.221973  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1579  hypothetical protein  40.74 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889797  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29110  hypothetical protein  32.79 
 
 		 175 aa  41.6  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1928  hypothetical protein  31.25 
 
 		 209 aa  41.2  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>