61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3825 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3825  phosphonate metabolism PhnG  100 
 
 		 167 aa  337  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.413231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4089  phosphonate metabolism PhnG  85.71 
 
 		 158 aa  248  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.220517  normal  0.0413085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1286  phosphonate metabolism PhnG  73.43 
 
 		 163 aa  197  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5848  PhnG protein  68 
 
 		 150 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.788351  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0762  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  74.6 
 
 		 157 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2196  phosphonate metabolism PhnG  47.1 
 
 		 175 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.901708  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4124  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  50.35 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3857  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  53.25 
 
 		 156 aa  124  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.553725  normal  0.921004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4438  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  47.65 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.825965 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0267  hypothetical protein  51.77 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1308  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  42.47 
 
 		 149 aa  120  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00253415  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0145  phosphonate metabolism PhnG  46.48 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162005  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2694  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  43.15 
 
 		 149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2559  phosphonate metabolism protein PhnG  47.97 
 
 		 154 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0521  phosphonate metabolism PhnG  42.66 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0575  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  39.72 
 
 		 147 aa  114  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0479  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  39.72 
 
 		 147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4342  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  42.25 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4655  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  42.25 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0887  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  42.76 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4603  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  41.26 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20360  putative phosphonate metabolism protein PhnG  47.14 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.357176  normal  0.656556 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4567  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  41.26 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2886  phosphonate metabolism PhnG  44.44 
 
 		 153 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0423726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3925  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  41.55 
 
 		 150 aa  112  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03933  hypothetical protein  41.55 
 
 		 150 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1749  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  47.14 
 
 		 152 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148039  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03973  carbon-phosphorus lyase complex subunit  41.55 
 
 		 150 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5614  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  41.26 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3703  phosphonate metabolism PhnG  45.33 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3773  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  46.98 
 
 		 167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3890  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  40.56 
 
 		 150 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2251  phosphonate metabolism PhnG  46.67 
 
 		 154 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.101673  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2179  putative phosphonate metabolism protein PhnG  47.33 
 
 		 165 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.118129 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0305  phosphonate metabolism PhnG  40.85 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.282377  normal  0.118238 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1316  phosphonate metabolism PhnG  49.3 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.245536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3694  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  38.61 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.468579  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3560  phosphonate metabolism protein PhnG  38.61 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4235  phosphonate metabolism PhnG  50.35 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.193267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2914  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  50.72 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6098  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  47.01 
 
 		 172 aa  99.4  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2400  alkylphosphonate utilization operon protein PhnG  38.86 
 
 		 182 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0316  phosphonate metabolism protein PhnG  38.86 
 
 		 182 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1177  phosphonate metabolism protein PhnG  38.86 
 
 		 182 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2586  phosphonate metabolism protein PhnG  38.86 
 
 		 182 aa  98.6  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0813  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  39.73 
 
 		 149 aa  98.2  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.73842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3345  phosphonate metabolism protein PhnG  38.86 
 
 		 182 aa  97.4  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3356  alkylphosphonate utilization operon protein PhnG  38.2 
 
 		 185 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5940  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  46.83 
 
 		 145 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3311  phosphonate metabolism protein PhnG  36.36 
 
 		 194 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4186  alkylphosphonate utilization protein PhnG  46.67 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4782  phosphonate metabolism PhnG  49.29 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.286403  normal  0.339522 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3328  alkylphosphonate utilization protein PhnG  42 
 
 		 151 aa  90.5  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2924  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  45.53 
 
 		 170 aa  87.4  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.237004  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4207  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  50.35 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1925  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  31.72 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.447942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2278  phosphonate metabolism protein PhnG  31.72 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.454708  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0766  phosphonate metabolism protein PhnG  40 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.869678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2957  putative phosphonate metabolism PhnG protein  39.35 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0242964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0228  phosphonate C-P lyase system protein PhnG  43.12 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.347019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2911  hypothetical protein  47.32 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>