32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3278 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3278  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 203 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.378202  normal  0.012285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2147  type IV pilus assembly PilZ  92.12 
 
 		 203 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3133  type IV pilus assembly PilZ  89 
 
 		 204 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3901  type IV pilus assembly PilZ  89.16 
 
 		 203 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5217  hypothetical protein  86.5 
 
 		 202 aa  358  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679888  normal  0.230089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2571  hypothetical protein  82.83 
 
 		 202 aa  343  8.999999999999999e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.520681  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2168  hypothetical protein  79.29 
 
 		 214 aa  332  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0136953  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1725  type IV pilus assembly PilZ  57.38 
 
 		 202 aa  223  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5127  type IV pilus assembly PilZ  53.41 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1855  type IV pilus assembly PilZ  51.03 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0262273  normal  0.0162783 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4632  type IV pilus assembly PilZ  48.94 
 
 		 213 aa  194  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.313334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2055  type IV pilus assembly PilZ  50.52 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2215  type IV pilus assembly PilZ  49.21 
 
 		 207 aa  191  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.190978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2533  type IV pilus assembly PilZ  47.69 
 
 		 207 aa  190  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2258  type IV pilus assembly PilZ  47.69 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3234  type IV pilus assembly PilZ  50.29 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal  0.496454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1043  type IV pilus assembly PilZ  46.96 
 
 		 202 aa  188  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2200  hypothetical protein  47.83 
 
 		 203 aa  188  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1935  type IV pilus assembly PilZ  46.2 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2643  type IV pilus assembly PilZ  38.89 
 
 		 205 aa  137  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.615004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5681  hypothetical protein  36.36 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637324  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1802  type IV pilus assembly PilZ  35.98 
 
 		 235 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1695  type IV pilus assembly PilZ  37.8 
 
 		 243 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0558499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4015  hypothetical protein  34.76 
 
 		 243 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.969553  normal  0.184937 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1075  type IV pilus assembly PilZ  35.59 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0474711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4427  type IV pilus assembly PilZ  38.67 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.787619 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0235  type IV pilus assembly PilZ  33.53 
 
 		 185 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3224  type IV pilus assembly PilZ  26.97 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4163  type IV pilus assembly PilZ  37.43 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3257  type IV pilus assembly PilZ  27.63 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3033  type IV pilus assembly PilZ  27.63 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0616001 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5084  type IV pilus assembly PilZ  27.38 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0293715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>